Generalnie nie stanowi to większego problemu, gdyż dla większości systemów plików o otwartej specyfikacji istnieją odpowiednie moduły do jądra, obsługujące dany system plików. Jedyny problem stanowią systemy o zamkniętej specyfikacji - jak to ma miejsce np. w przypadku NTFS. Co prawda istnieją standardowe moduły jądra, obsługujące podstawowe operacje na tym systemie plików, lecz w zasadzie ograniczają się one wyłącznie do odczytu - możliwa jest co prawda modyfikacja, jednak nie może ona zmieniać rozmiaru pliku. Istenieją też komercyjne produkty dla Linuksa, umożliwiające pełen dostęp do systemu NTFS - jednym z takich programów jest Paragon NTFS for Linux .