Architektura x64 pozwala zachować kompatybilność z architekturą x86, dlatego przy wsparciu systemu operacyjnego można na niej uruchamiać programy 32-bitowe. Wiele komputerów jest dziś wręcz sprzedawanych z systemami 32-bitowymi, które nie pozwalają na wykorzystanie nowych możliwości. W tej architekturze segmentacja nie pełni istotnej roli, jest zachowana tylko dla kompatybilności, a metody ochrony są wykorzystane w stronicowaniu.