Wprowadzenie kart pamięciowych nie rozwiązało bardzo ważnego problemu -- ochrony przechowywanych danych. Świat zewnętrzny decyduje pod jakim adresem fizycznym mają zostać zapisane lub odczytane dane, ma więc pełną kontrolę nad przechowywanymi na karcie informacjami. Nie wchodzi więc w rachubę wykorzystanie takich kart do przechowywania salda konta w systemie elektronicznej gotówki, czy do przechowywania tajnych kluczy, a nawet do zliczania impulsów telefonicznych w systemach telefonii publicznej. Uznano jednak, że obrany kierunek rozwoju, tj. umieszczanie obwodów elektronicznych w plastikowej karcie jest słuszny i warto go kontynuować.
Wprowadzono karty pamięciowe z ochroną danych (ang. protected memory cards). Są to karty pamięciowe wyposażone w układ pamięci oraz zwykle dość prosty układ ograniczający dostęp do niej. Wymaga on podania numeru PIN (ang. Personal Identification Number) lub innego rodzaju hasła przed wykonaniem operacji odczytu lub zapisu pamięci. Dodatkowo dla zwiększenia bezpieczeństwa obydwa obwody umieszczone są w jednym module, tak aby nie można było dostać się do układu pamięci, omijając układ ochrony danych, nawet po zniszczeniu plastikowej karty, w której moduł jest umieszczony.
Stosowany w tym typie kart mechanizm ochrony jest bardzo prosty, co:
Wymienione cechy powodują, że najczęstszym sposobem wykorzystania tego typu kart są systemy telefonii publicznej.