Pierwszych szesnaście rekordów MFT jest zarezerwowanych na pliki systemowe:
| Inode | Nazwa pliku | Opis |
|---|---|---|
| 0 | $MFT | Master File Table - spis wszystkich plików |
| 1 | $MFTMirr | Kopia zapasowa pierwszych czterech rekordów MFT. Zazwyczaj usytuowana w logicznym środku dysku. |
| 2 | $LogFile | Dziennik transakcji |
| 3 | $Volume | Informacje o partycji. Jedyny plik, który używa atrybutów $VOLUME_NAME i $VOLUME_INFORMATION |
| 4 | $AttrDef | Definicje atrybutów |
| 5 | . (dot) | Katalog główny |
| 6 | $Bitmap | Mapa bitowa wszystkich klastrów dysku (wolny/zajęty). |
| 7 | $Boot | Boot record |
| 8 | $BadClus | Lista uszkodzonych klastrów. |
| 9 | $Secure | Lista wszystkich zabezpieczeń nałożonych na pliki na dysku. |
| 10 | $UpCase | Tablica służąca do zamiany małych liter na duże. |
| 11 | $Extend | Katalog zawierający pozostałe pliki systemowe: $ObjId - lista unikalnych identyfikatorów dla wszystkich plików. $Quota - informacja o quocie. $Reparse - spis reparse points. $UsnJrnl - dziennik enkrypcji. |
| 12-15 | <Unused> | Puste |
Cztery ostatnie rekordy są zarezerwowane na wypadek, gdyby MFT uległa dużej fragmentacji. Ponieważ MFT zawiera także wpis dla siebie samej, w przypadku, gdyby potrzebowała nowych rekordów na zapisanie danych o sobie, mogłoby dojść do zapętlenia. Nowe rekordy z atrybutami MFT są więc w takich sytuacjach wpisywane w te uprzednio przygotowane miejsca.