W rozdziale tym przedstawiamy przykładowe topologie sieci i ich konfiguracje wraz z omówieniem scenariuszy użycia. Przedstawiamy również wyniki symulacji wraz z omówieniem ich możliwej interpretacji. Są to tylko przykłady pokazujące wybrane możliwości systemu PROTONET. Przykłady takie można mnożyć pod kątem oczekiwanych celów dydaktycznych.